久久精品国产亚洲AV麻豆长发,亚洲蜜芽在线观看精品一区,免费的国产MMORPG,韩国一区二区三免费看

您好!歡迎訪問保定米奇生物科技有限公司網(wǎng)站!
全國服務(wù)咨詢熱線:

19801430409

當(dāng)前位置:首頁 > 產(chǎn)品中心 > > 技術(shù)服務(wù) > Ribo-seq

Ribo-seq

簡要描述:核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq)檢測正在翻譯的RNA信息,揭示蛋白合成的時間,位置,以及蛋白質(zhì)合成的調(diào)控機(jī)制。

  • 產(chǎn)品型號:
  • 廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家
  • 更新時間:2024-06-28
  • 訪  問  量:2183

詳細(xì)介紹

品牌其他品牌

技術(shù)原理

蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,翻譯調(diào)控又是細(xì)胞內(nèi)重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達(dá)的關(guān)鍵步驟。翻譯的過程受到嚴(yán)格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關(guān),比如神經(jīng)退行性疾病、貧血癥和發(fā)育障礙等。雖然核糖體的結(jié)構(gòu)與功能研究的比較透徹,但是對于翻譯過程的調(diào)控機(jī)理還需要深入研究。

核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq),能夠詳細(xì)檢測體內(nèi)的翻譯狀態(tài)。Ribo-seq的技術(shù)核心是識別與核糖體結(jié)合的mRNA以及正在被翻譯的約30個核苷酸。對核糖體結(jié)合的mRNA片段進(jìn)行測序,能夠精確記錄核糖體在翻譯過程中的位置。將轉(zhuǎn)錄組與Ribo-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,可以計算出蛋白質(zhì)的合成速率。

技術(shù)特點(diǎn)

Ribo-seq能夠揭示蛋白合成的時間、地點(diǎn)、位置、哪些蛋白質(zhì)正在被合成以及蛋白質(zhì)合成的調(diào)控機(jī)制。Ribo-seq搭建了從轉(zhuǎn)錄組學(xué)到蛋白質(zhì)組學(xué)之間的橋梁,已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。

應(yīng)用方向

Ribo-seq應(yīng)用于研究轉(zhuǎn)錄本的翻譯活性、鑒定翻譯起始位點(diǎn)、ORF位置和蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制。

Ribo-seq技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制??傊?,Ribo-seq能從基因組水平檢測蛋白質(zhì)的翻譯狀況,獲得正在翻譯的mRNA序列信息并解析翻譯調(diào)控機(jī)制。

藍(lán)景科信優(yōu)勢

實(shí)驗周期快、質(zhì)量高、結(jié)果穩(wěn)定可靠。

豐富的物種經(jīng)驗。

實(shí)驗流程

Ribo-seq

分析內(nèi)容

標(biāo)準(zhǔn)生信分析

(1)原始數(shù)據(jù)過濾與測序質(zhì)量評估

(2)比對去除核糖體RNA、tRNA、sRNA等

(3)Reads長度分布統(tǒng)計與長度過濾

(4)比對參考基因組

(5)測序飽和度分析

(6)RF在基因組上的分布統(tǒng)計與分類

(7)三堿基節(jié)律分析

(8)翻譯基因統(tǒng)計與表達(dá)量分析

(9)樣本關(guān)系分析

(10)組間差異翻譯基因分析

(11)差異翻譯基因的GO和KEGG功能富集分析

Ribo-seq與RNA-seq的聯(lián)合分析

(1)翻譯效率計算

(2)Ribo-seq與RNA-seq的相關(guān)性分析

(3)翻譯效率與轉(zhuǎn)錄水平的關(guān)聯(lián)分析

Ribo-seq

分析流程

Ribo-seq

實(shí)驗案例

Ribo-seq

Ribo-seq

Ribo-seq

送樣要求

(1)細(xì)胞樣本:建議送樣量5×106-1×107個。

(2)動物組織樣本:建議送樣量≥300 mg。

(3)植物組織樣本:建議送樣量≥500 mg。

樣本分組

至少2組樣品,包括對照組和實(shí)驗組,樣本數(shù)建議:3 Vs 3。

參考文獻(xiàn)

Brar GA, Weissman JS. Ribosome profiling reveals the what, when, where and how of protein synthesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2015. 16(11):651-664.

Chong C, Coukos G, Bassani-Sternberg M. Identification of tumor antigens with immunopeptidomics. Nat Biotechnol. 2022. 40(2):175-188.

Fremin BJ, Nicolaou C, Bhatt AS. Simultaneous ribosome profiling of hundreds of microbes from the human microbiome. Nat Protoc. 2021. 16(10):4676-4691.

Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS. The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments. Nat Protoc. 2012. 7(8):1534-1550.

Ingolia NT, Ghaemmaghami S, Newman JR, Weissman JS. Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling. Science. 2009. 324(5924):218-223.

Juntawong P, Girke T, Bazin J, Bailey-Serres J. Translational dynamics revealed by genome-wide profiling of ribosome footprints in Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014. 111(1):E203-212.

Sawyer EB, Cortes T. Ribosome profiling enhances understanding of mycobacterial translation. Front Microbiol. 2022. 13:976550.

Xiang Y, Huang W, Tan L, Chen T, He Y, Irving PS, Weeks KM, Zhang QC, Dong X. Pervasive downstream RNA hairpins dynamically dictate start-codon selection. Nature. 2023. 621(7978):423-430.

Xu G, Greene GH, Yoo H, Liu L, Marqués J, Motley J, Dong X. Global translational reprogramming is a fundamental layer of immune regulation in plants. Nature. 2017. 545(7655):487-490.





產(chǎn)品咨詢

留言框

  • 產(chǎn)品:

  • 您的單位:

  • 您的姓名:

  • 聯(lián)系電話:

  • 常用郵箱:

  • 省份:

  • 詳細(xì)地址:

  • 補(bǔ)充說明:

  • 驗證碼:

    請輸入計算結(jié)果(填寫阿拉伯?dāng)?shù)字),如:三加四=7
保定米奇生物科技有限公司
地址:保定市惠陽街369號保定中關(guān)村創(chuàng)新基地研發(fā)中心15層1508室
郵箱:info@michlab.cn
傳真:
關(guān)注我們
歡迎您關(guān)注我們的微信公眾號了解更多信息:
歡迎您關(guān)注我們的微信公眾號
了解更多信息
久久自己只精产国品| 人妻激情偷乱一区二区三区| 亚洲AV午夜成人片精品网站| 国产精品美女久久久浪潮av| 欧美黑人粗暴多交高潮水最多| 国产精品一区二区| 欧美性xxxxx极品少妇直播| 国产精品久久久久久久久免费蜜桃 | 亚洲熟女色情网中文字幕| WWW.一本色道88久久爱| 我的初次内射欧美成人影视| 精品人妻人人爽久久爽av| 天天躁日日躁狠狠躁人妻| 国产98在线 | 日韩| 端庄美艳人妻教师的沉沦| 久久久久久久精品成人热小说| 久久久久久AV无码免费网站下载| 99久久国产综合精品成人影院| 亚洲av无码专区国产精品麻豆| 99热久久精里都是精品6| 人妻秘书汗と接吻に満ちた视频| 二区国产好的精华液单品榜| 奇米777四色777欧美在线| 亚洲av无码一区二区三区四区| 欧美成A人片在线观看久| 久久人妻熟女一区二区| 2021少妇久久久久久久久久| 午夜精品久久久久久久99热| 久久婷婷久久一区二区三区| 丝袜 亚洲 另类 欧美 变态| 最近中文字幕免费完整影视| 亚洲精品美女久久7777777| 欧美成人精精品一区二区三区| 久久99国产精品久久99蜜桃| 久久久久久久99精品国产片| 国产精品美脚玉足脚交欧美| 久久成人无码国产免费播放| 人人妻人人爽日日人人| 99精品亚洲AV无码国产另类 | 性久久久| 久久精品噜噜噜成人av|